Mustafa Ağatekin, 1991 yılında o zamanki adıyla Anadolu Üniversitesi Uygulamalı Güzel Sanatlar Yüksekokulu Seramik Bölümünden mezun oldu. Yüksek lisansını ve sanatta yeterliliğini aynı üniversitede yaptı. 1993 yılından 2002 yılına kadar seramik çalışmalarına, hem akademik düzeyde hem de sanatçı olarak devam etti. Cam ile 2002 yılında çalışmaya başladı, 2004 yılında Anadolu Üniversitesi Cam Bölümünün eğitim öğretime başlamasıyla bu kurumda öğretim görevlisi olarak çalışmaya başladı. 2009 yılında doçentliği aldı ve 2009-2012 yıllları arasında cam bölüm başkanlığı görevlerini yaptı. Çalışmalarına kuruluşundan bugüne halen Anadolu Üniversitesi Güzel Sanatlar Fakültesinde devam eden Ağatekin, bugüne kadar 12 kişisel sergi, ulusal ve uluslararası ölçekte pek çok karma sergi, sempozyum, festival gibi etkinliklerde yer almıştır. Ulusal ölçekte 4 ödülü bulunan sanatçının eserleri kişisel ve kurumsal koleksiyonlarda yer almaktadır.